有關諾亞方舟之謎至今未解。但近年來，隨著考古研究的發展，也有越來越多的事實證明，盡管在《圣經》中說上帝發水一說毫無根據，但在人類歷史上確實有過全球性洪水的先例，也就是說遠古時代的人們確實經歷過毀滅性的水災。

據《圣經》記載，大約6000年以前世上的人除諾亞和他的一家外都忘了上帝。上帝發怒了，決定懲罰他們。在諾亞600歲的2月17日那天，天窗打開了，上帝連降大雨40天，世界隨即變成一片汪洋大海，地球上的一切生物除諾亞方舟外都處于毀滅的邊緣。諾亞由于得到上帝的寵愛提前知道洪水的到來，便造了一艘大船，這就是“諾亞方舟”。他和他的家人正是借助這艘船才得以生存下來。同時在逃難中，諾亞還將世界上每種生物都帶了一對，這就發展成為今天的人類和生物界。

1850年，考古學家亨利·萊亞德在古亞述國首都尼尼微挖掘出上千片殘破的粘土板。這里被考古學界認為是世界上最早的文明古國之一——蘇美爾的所在地。經仔細研究，這些泥板被斷定已有5500多年的歷史。

這幅畫是威尼斯圣馬可教堂的馬賽克鑲嵌畫。這幅畫上面顯示在方舟上的諾亞一家人，諾亞將世界上所有的動物從方舟一雙雙放出。

考古專家喬治·史密斯先生還在這些泥板中發現了一塊古巴比倫記述的《古爾蓋梅希史詩》中的一段。它記述了一場吞沒世界的大洪水中一個叫萬塔·納皮提姆的人和他的妻子乘一條大船逃生的故事，這個描述與諾亞方舟的故事如出一轍。難道還真有這么回事嗎？有的學者認為這絕非單純巧合，其間必有某種聯系。有的進一步認為發生洪水的區域可能就是幼發拉底河和底格里斯河，因為這兩條河都流經此地。

1955年7月，法國探險家那巴拉帶著自己的兒子拉菲爾追尋了諾亞方舟的蹤跡。他們根據《圣經》記載，登上了位于前蘇聯境內海拔5400多米的阿拉拉特山。他們四處勘察，結果在山中的冰湖里發現了一塊木塊，形狀酷似諾亞方舟的殘骸。于是，他們帶上木塊很快離開阿拉拉特山回到法國。后來經科研機構考證，一致確認木塊至少為5000年前的建筑物的一部分。而據科學考查，諾亞生活的時代也正是在6000年前左右。那么這塊木塊及100多年前發現的上千片粘土板是不是諾亞方舟的組成部分？諾亞方舟是否存在過呢？還只是一段傳奇的神話呢？

現代科學證明，諾亞方舟的故事發生的時期是第四紀多雨的大西洋期，那時極可能產生巨大洪水。

最早尋找諾亞方舟的是一些虔誠的基督教徒，但沒有結果。后來，一些探險家也加人了這一行列1792年、1850年、1876年，探險家們屢次登上阿美尼亞的艾亞特拉山頂，仍然一無所獲。

艾亞特拉山位于土耳其東端。靠近伊朗，是一座海拔5065米的活火山，山頂自古就被冰川覆蓋。住在這里的阿爾明尼亞人將其稱做神山，相信人若登上山頂會被上帝懲罰，故而長期以來無人敢于攀登。

取得突破性進展是在1883年，當時，一次大地震使艾亞特拉山脈的一個冰川地段開裂了，據說開裂處露出了一條船。當時，有個赴艾亞特拉山區考察和評估地震災情的委員會，委員會的所有成員都親眼看到過那條大船，船身有12一15米高，因為木船有一大部分還嵌在冰川里，無法估計它的長度。這一消息震驚了當時世界。

多年過去，到了1916年。第一次世界大戰期間，俄國飛行員羅斯克維斯基在執行偵察任務之后沿著土耳其與伊朗邊境飛回基地當飛越艾亞特拉山上空時，他驀然發現山頂上有一團青紫色的奇怪東西，極大的好奇心促使他急忙把飛機掉過頭來細看，他驚訝地看到山上有一艘很大的船體，船的一側還有門，其中一扇門已毀壞。他拍下了照片，回去后，把這件事報告了沙俄政府。政府馬上派出兩個連的兵力去尋找方舟。1個月后，士兵們找到了，并且進行了全面測量，拍攝了大量照片。方舟里有幾百個房間，有些交叉的木塊做成的大柵欄，這些房子前面還有一排排鐵栓……

在此之后，尼古拉二世本打算派探險隊考察，但由于十月革命爆發未果。此后，美國、法國一些探險家相繼來到艾亞特擬頂，但運氣不佳，一無所獲。1955年7月，法國的瓊·費爾南·納瓦拉帶著兒子拉法埃爾登上艾亞特拉山頂，從冰川中找到方舟殘片，帶回一塊木板，經西班牙、法國、埃及等國科學家研究，這是一塊經過特殊防腐涂料處理的木板。經過碳14測定，它的年代至少在4484年前。

1986年4月9日，土耳其官方通訊社宣布，諾亞方舟遺跡在艾亞特拉山被發現。但科學界對世紀大洪水的起源，始終抱持懷疑態度，至今仍不斷找尋遺跡以作證實。

不過也有相當多的科學家承認大洪水的存在。據土耳其科學家表示，約在13000至14000年前，世紀大洪水高大的浪潮自今日的黑海漫過馬爾馬拉海進人地中海，并且在高達數百甚至數千公尺高的巨大浪潮沖進地中海時，淹沒了許多人類居住地，因此形成今日的愛琴海島嶼星羅棋布，至少有兩千座島嶼，海底下也可能埋藏了許多傳說中陸沉的“阿特蘭蒂斯城，‘。

土耳其西部愛琴海國立九月九日大學海洋科學技術研究所海洋研究小組自]995年開始，就與加拿大的多倫多大學合作，搭乘海洋研究船，在土耳其北部黑海及西部愛琴海域進行海層及海底勘察，在黑海海底發現許多疑似早期人類居住的痕跡，推斷黑海居民在遭到洪水侵襲后，往最近的高地遷移，即今日土耳其東部與亞美尼亞毗鄰的阿拉拉特山(Ararat)區，最高峰海拔五千公尺，后來在洪水減退后又轉往埃及等地，締造了新的文明。

1997年美國哥倫比亞大學地理學家彼特曼(Walterpit-Williamman)與里昂(williamRYen)在《諾亞大洪水》一書中認為：”約在一萬年前，冰河時期結束，地中海水位上引后，注人馬爾馬拉山谷〔即今日的馬爾馬拉海)，水位漲滿后又經由今日的博斯普魯斯海峽進入黑海，形成《圣經》上所稱的世紀大洪水，又稱諾亞大洪水。“

雖然有關諾亞方舟的發現時而傳來，但是堅信此事為子虛烏有的科學家也大有人在。總結起來反駁者的觀點主要集中于以下幾點阿美尼亞的艾亞特拉山海拔5185米。如果洪水真淹到山頂，有那么多的水，以后這些水怎么會不見了？即使說水全滲入地下，也不會有那么快。據《圣經》描述。方舟體積有43097立方米，這個體積不可能裝下世界所有動物的雌雄各7只，何況還有大量的食物需要攜帶。

即便如此，方舟的探索者們仍然興致勃勃，一個美國學者提議：將方1B認冰河內整個地發掘出來，搬人世界上最著名的博物館中，供人們研究、參觀或追憶往古。假若阿美尼亞的艾亞特拉山上真有這么一個古船的話，理應如此。