根據(jù)國(guó)家第一歷史檔案館清代滿文檔案和地方民族史資料記載，黑龍江省的柯爾克孜人，是清雍正十一年(1733)由現(xiàn)今俄羅斯聯(lián)邦哈十斯共和國(guó)的葉尼塞河上游一帶自西向東途徑蒙古大草原土-遷嫩江草原烏裕爾河畔，并編入八旗，享受旗人待遇一直到清末，觀在的黑龍江省富裕縣柯爾克孜族人都是他們的后裔。

柯爾克孜族是本民族的自稱。在我國(guó)漢文史書中曾先后被寫作“鬲昆”、“隔昆”堅(jiān)昆、“結(jié)昆”、“契昆”、“護(hù)昆”、“紇挖斯”、“黠戛斯”、“轄戛斯”“黠戛司”、“紇里迄斯”、“吉里吉斯’’等。在清代被稱作“布魯特”。遷入黑龍江省的這部分柯爾克孜人，當(dāng)?shù)厝朔Q其為“厄魯特”或“蒙古”。中華人民共和國(guó)成立后，于1952年確認(rèn)的吉爾吉斯族，1960年改稱“柯爾克孜族。

柯爾克孜族是一個(gè)具有悠久歷史的古老民族，是祖國(guó)大家庭成員之一。在我們中華民族漫長(zhǎng)的歷史中，柯爾克孜族人民以勤勞的雙手和聰明才智，開拓創(chuàng)造了本民族的經(jīng)濟(jì)文化，在中華民族的文明史上，留下了光輝的一頁(yè)。

柯爾克孜的先世，最初游牧于我國(guó)北方的葉尼賽河上游。漢文史籍中稱為“鬲昆”、“堅(jiān)昆”。秦代的鬲昆還是一個(gè)互不統(tǒng)轄的游牧部落，不隸屬于任何政權(quán)。

唐代堅(jiān)昆又稱黠戛斯。公元684年，唐在結(jié)骨地區(qū)設(shè)堅(jiān)昆都督府，并封黠戛斯首領(lǐng)失缽屈阿棧為堅(jiān)昆都督左屯衛(wèi)大將。堅(jiān)昆都督府隸屬于關(guān)內(nèi)道、燕然都護(hù)府。

回紇西遷之后，黠戛斯成為北方一個(gè)強(qiáng)大的部落。《新唐書·黠戛斯傳》載：此時(shí)，黠戛斯人“擁眾十萬(wàn)，勝兵八萬(wàn)”;并建立了隸屬唐王朝的“黠戛斯汗國(guó)”。實(shí)際控制著我國(guó)北方的東起歉河(葉尼塞河)，西到塔拉斯的大片土地。

到了遼、北宋時(shí)期，居住在北方的黠戛斯又稱為“轄戛斯”，受遼的統(tǒng)治。而西遷天山南北和帕米爾的黠戛斯則同回鶻、樣磨、處月、葛邏祿等部組建了喀拉汗王朝。當(dāng)時(shí)的烏什、阿合奇以及喀什噶爾以北的大片土地，由轄戛斯統(tǒng)治著。

元代轄戛斯被稱為吉利吉思，隸屬于元朝。元在我國(guó)北方設(shè)嶺北行省，下轄益蘭州等部斷事官。這時(shí)的吉利吉思占有我國(guó)北方的益蘭州、歉州兩州之地，屬益蘭州斷事官管轄。居住在克孜勒蘇及中亞、伊犁一帶的吉利吉思則屬察合臺(tái)后王土封地。

明代，稱吉利吉思為乞爾吉斯，受轄于蒙古瓦剌部，克孜勒蘇境內(nèi)的乞爾吉斯受轄于亦力把里。

清代，稱乞爾吉斯為“布魯特”。居住在伊犁河流域和天山山區(qū)(含今阿合奇縣及阿圖什縣山區(qū))的稱東布魯特，居住在烏恰縣、阿克陶縣以及帕米爾高原及以西地區(qū)的稱西布魯特。

清代由于沙俄對(duì)我國(guó)西北邊疆的擴(kuò)張，把我國(guó)帕米爾高原上的大部分布魯特人居住區(qū)占為沙俄領(lǐng)地，留在我國(guó)領(lǐng)土上的布魯特人只有三分之一。

1949年新疆和平解放，柯爾克孜族歷史揭開了嶄新的一頁(yè)。

1954年7月14日，克孜勒蘇柯爾克孜自治州成立。