傳說在四千六百多年以前的上古時(shí)期，黃帝的部落(以黃河流域?yàn)橹?跟蚩尤的部落大戰(zhàn)于涿鹿之野，雙方打了一年多，不分勝負(fù)。黃帝苦悶填心，憂心如焚。一天夜里，忽然夢(mèng)到了九天玄女娘娘。九天玄女娘娘對(duì)他說：你要戰(zhàn)勝蚩尤，必須找到九星運(yùn)轉(zhuǎn)時(shí)倒映于地上的奇點(diǎn)和吉門。用背孤?lián)籼撝ǎ纱螳@全勝。九天玄女娘娘在教給他一些秘訣后，便飄然離去。黃帝醒來，馬上將這些秘訣整理成書，就是《奇門遁甲》，又選了一個(gè)吉日良辰，修了一個(gè)很大的高臺(tái)，于臺(tái)上致祭，正式啟用“奇門遁甲”。祭祀完后，黃帝就用“奇門遁甲”之方法，對(duì)蚩尤進(jìn)行全面反攻。交戰(zhàn)中蚩尤作法興起了漫天大霧，企圖利用大霧的幫助來消滅黃帝。而黃帝在“奇門遁甲”的指導(dǎo)下，馬上辨清了方向，又用背孤?lián)籼撝ǎ瑥纳T打向死門一舉戰(zhàn)勝蚩尤。

此后黃帝把“奇門遁甲”視為至寶，為了長久保存，便命風(fēng)后把它刻到甲骨上。這風(fēng)后也是知天文，曉地理，通算術(shù)，明陰陽的行家。她在太極生兩儀，兩儀生四象(春、夏、秋、冬)的啟發(fā)下，將黃帝的一時(shí)一局改為了四時(shí)一局。她用四個(gè)時(shí)辰來象征一年中的四個(gè)季節(jié)，把四千三百二十局，刪成了一千零八十局。一千零八十局中，又分為陽遁五百四十局和陰遁五百四十局。這就是“奇門遁甲”歷史上的第一次改革。

到了商朝末年，有一個(gè)叫姜子牙的人于昆侖山上學(xué)得此術(shù)，下山后看到商朝天子紂王無道，涂炭生靈，殘害百姓，人民生活在水深火熱之中，而周室興隆之氣漸現(xiàn)，于是就用“奇門遁甲”去輔佐周室武王。他運(yùn)用星門變換、踏罡步斗和神遁法門(九天、丙、生門)等方法，幻化時(shí)空，改死為生，從而達(dá)到了推翻商朝建立周朝的目的。姜子牙在“奇門遁甲”的運(yùn)用中，覺得一千零八十局還太繁鎖，于是又把它跟一年中的七十二侯聯(lián)系起來，改一千零八十局為七十二局，這就是“奇門遁甲”歷史上的第二次改革。

到了秦朝末年，一個(gè)叫張良的青年人，有一次經(jīng)過下邳的圯上，遇一老者坐于其上，而鞋子卻掉到橋下去了，老者很不禮貌的對(duì)張良說：“小子，快給我把鞋子撿起來！”張良待要發(fā)怒，見是一老者，只得把怒氣忍了下去，怏怏地走到橋下幫老人撿起了鞋。老者又傲慢地對(duì)他說：“穿上！”張良再一次強(qiáng)忍著不平之氣為其穿上。老者起身揚(yáng)長而去，但去不數(shù)步，卻又折轉(zhuǎn)身來對(duì)張良說：“后五日平明在此等我。”五日后的平明張良趕到約會(huì)地點(diǎn)，老者已先到了。老者見張良晚于他，非常生氣地說：“與老人約會(huì)，為什么滯后？五日后再會(huì)。”五日后雞尚未鳴，張良便來到了約會(huì)地點(diǎn)，可老者又先到了。老者再次生氣地說：“這一次又晚于我，為什么？后五日再會(huì)！”這次還沒到半夜，張良就趕到了約會(huì)地點(diǎn)。老者也隨之趕到，并從懷中取出一本書來送給張良說：“讀了此書，可以作帝王之師;可以幫助有帝王氣慨的人建立新的朝代……”這本書就是“奇門遁甲”。

張良憑著自己的刻苦精神和聰明才智，很快就把“奇門遁甲”的原理弄通了。他感到“奇門遁甲”局?jǐn)?shù)雖多，卻跳不出洛書九宮之?dāng)?shù)，因此也對(duì)“奇門遁甲”進(jìn)行了一次刪改。他把姜子牙的七十二局減到了十八局，在十八局中再分陰九局和陽九局，使“奇門遁甲”的布局更為精當(dāng)，這就是“奇門遁甲”歷史上的第三次改革。張良后來在幫助漢高祖劉邦推翻秦朝、平定諸候、戰(zhàn)勝項(xiàng)羽的過程中，最常用的就是天遁、地遁和三奇并進(jìn)之方法。

三國時(shí)，曹操率百萬大軍攻打東吳，雙方戰(zhàn)艦分列于長江兩岸。東吳大將軍周瑜想用“火”來攻克對(duì)方，而用火攻就必須要有東南風(fēng)，隆冬之時(shí)，又哪里有東南風(fēng)呢？因此周瑜憂慮成疾一病不起。諸葛亮前來探病，對(duì)周瑜說：“亮雖不才，曾遇異人，傳授奇門遁甲天書，可以呼風(fēng)喚雨。都督若要東南風(fēng)時(shí)，可于南屏山建一臺(tái)，名曰七星壇……。”周瑜聽完隨即病好，火速于南屏山上建起一臺(tái)。此臺(tái)高九尺，作三層。諸葛亮用一百二十名士兵守護(hù)，于臺(tái)上按二十八宿的方位屬性樹起青、紅、白、黑二十八面旌旗，又布以八門、八卦、九星，然后踏罡步斗，仗劍念咒，趨使六丁六甲，終于幫周瑜借來了東南大風(fēng)，使其順利的戰(zhàn)勝了曹操的百萬雄兵……。諸葛亮一生貫用“奇門遁甲”，到死之時(shí)還想用“奇門遁甲”借壽，不料被魏延撞翻了七星燈而未成。

中國的先人用“奇門遁甲”建邦立國的例子太多了，如：唐朝的徐茂公，明朝的劉伯溫等等…… 都是用“奇門遁甲”來行兵打仗奪取江山的，所以“奇門遁甲”倍受帝王喜愛，并珍藏而暗習(xí)之，“奇門遁甲”也因此被稱作帝王之學(xué)。

在中國幾千年的歷史長河中，“奇門遁甲”術(shù)在選擇傳人時(shí)非常地慎重和嚴(yán)謹(jǐn)，一般是單傳和秘傳。有的師傅把此書藏于山洞之中，待百年后的有緣人得而習(xí)之。社會(huì)上流傳的“奇門遁甲”訛本較多，真本難得，少數(shù)真本也是錯(cuò)誤百出，使學(xué)者難登堂奧，只得望洋興嘆！

“奇門遁甲”開始主要用于行兵打仗，即如何布奇門以打敗敵軍;如何在遇到強(qiáng)大不可抵抗的敵軍時(shí)，隱遁保全自己的部隊(duì);如何呼風(fēng)喚雨為我所用;如何對(duì)世間的事物進(jìn)行預(yù)測……

解放戰(zhàn)爭初期，閻錫山的部隊(duì)大舉進(jìn)攻延安，毛澤東只好帶著他的中央機(jī)關(guān)轉(zhuǎn)移(逃跑)。當(dāng)毛澤東跑到一個(gè)歧路口時(shí)，便指揮部隊(duì)走東邊的一條路，并于路邊立了一塊：“毛澤東由此向東”的牌子，看到牌子，追上來的敵兵一下子不知所措了，毛澤東也就順利地?cái)[脫了敵人的追擊。后來聽人們說，毛澤東身邊有懂“奇門遁甲”的人。毛澤東所走的那條路，剛好上臨丙奇與九天，下臨生門，時(shí)間、空間的交匯形成了一個(gè)盲點(diǎn)。在盲點(diǎn)上人們?nèi)菀桩a(chǎn)生視而不見之狀況，好象大腦思維突然停滯了一樣。

“奇門遁甲”以九星二十八宿的運(yùn)轉(zhuǎn)來體現(xiàn)時(shí)間場和空間場的變換及其相互之間的關(guān)系與規(guī)律。它以八卦來體現(xiàn)空間場的作用;以八門來體現(xiàn)人事的代謝和社會(huì)的變遷;以八神來體現(xiàn)虛性波狀(虛子)世界的神秘物質(zhì)的力量和價(jià)值。總的來說，它是以天盤來模擬天道;地盤來模擬地道;人盤來模擬人道;神盤來模擬神道;它是中國古代圣人對(duì)宇宙運(yùn)動(dòng)變化的模擬圖。