作為蒙古最后一任大汗，林丹汗背負著民族的希望和未來。可是，他即位時已經是1604年，此時南有明朝，東北有后金，都是不可小視的力量，尤其是努爾哈赤的后金，更是崛起迅速。他的父親莽骨還早逝，他從爺爺布延薛禪汗那里接過沉甸甸的汗位，也接過來一個即將四分五裂的蒙古各部。

終其一生，他都在與后金作戰，只是令他想不到的是，1634年，四十三歲的他病死在青海大草灘后，他留下的一切，他的江山，他的部下，甚至他的妻子兒女，全都歸順到了后金手里。

后金天聰八年八月，林丹汗的側福晉，時稱竇土門福晉，率先到皇太極的軍營行幄。皇太極接納了她的人馬，娶了竇土門福晉。崇德元年七月她被封為東衍慶宮淑妃，位居崇德五大福晉的第四位。

后金天聰八年，林丹汗的多羅大福晉囊囊太后娜木鐘生下林丹汗的遺腹子阿布鼐。第二年三月，她率領一千五百戶部眾來歸。她是林丹汗的正室大福晉，八大福晉之首。統管阿紇土門萬戶斡耳朵。蒙古阿霸垓部后封郡王額齊克諾顏之女。改嫁愛新覺羅·皇太極后，為他生下襄昭親王博穆博果爾和固倫端順公主，地位尊貴。

四月，林丹汗另一個多羅大福晉蘇泰太后帶著她的兒子額哲，即林丹汗的繼承人，又率一千戶部眾來投，并獻上歷代傳國玉璽。葉赫那拉氏蘇泰，是葉赫部德爾赫禮臺吉之女。歸順后金，改嫁愛新覺羅·濟爾哈朗。她是濟爾哈朗已去世的繼福晉之姊。

隨同兩位尊貴太后前來的還有林丹汗另兩位側室福晉伯奇福晉。伯奇福晉，名苔絲娜。歸順滿清后，改嫁愛新覺羅·豪格為其側福晉。俄爾哲依圖福晉，歸順滿清，改嫁愛新覺羅·阿巴泰。疑為阿巴泰時已去世的元配嫡福晉那拉氏之妹。

至于林丹汗的二妹，二公主在林丹汗死后，與眾福晉一起歸附滿清，改嫁愛新覺羅·代善。

她們的到來，讓皇太極和諸王貝勒們欣喜若狂，因為不但送來美女，還帶來了眾多的家產人口及牲畜財帛等。

關于他的兩個兒子，長子額爾孔果洛額哲是蘇泰大福晉生的。歸順后金以后，皇太極將次女馬喀塔許配給他。1636年(清崇德元年)完婚。同年，額哲被封為察哈爾親王。1641年(清崇德六年)額哲因病去世。額哲死后，她又嫁給額哲之弟阿布鼐。

次子阿布鼐，母親是囊囊大福晉娜木鐘。他是林丹汗的遺腹子。順治二年(1645年)，娶寡嫂。三年后，他襲遺爵封察哈爾親王。相比較哥哥，他雖然沒有見過父親，但是他對先人的恥辱耿耿于懷，多年不朝覲。于是被革職下獄。他的兒子們因為趁著吳三桂等人的叛亂，想營救父親出京，結果兵同命運，阿布鼐也因"負恩失禮"被削爵處死，走完了看似風光卻悲催的一生。