吳三桂殺害永歷帝后，清順治帝給他很重的獎(jiǎng)賞，封他做平西王，讓他鎮(zhèn)守云南、貴州，給他許多特權(quán)，管轄兩省的文武官員，可以隨意任免官員;處理軍民一切事務(wù)，還可以開礦山，煮井鹽，鑄造錢幣，清廷每年還要撥給他餉銀九百多萬(wàn)兩，占了國(guó)庫(kù)的很大一部分。吳三桂自恃功高，在云南稱王稱霸。

公元1662年，順治帝去世，才八歲的康熙帝即位。順治帝臨死前有遺詔，命鰲拜等四個(gè)滿洲大臣做康熙的輔政大臣，幫助處理國(guó)家大事。鰲拜立過戰(zhàn)功，手握兵權(quán)，根本不將小皇帝放在眼里，更不愿意與其他三個(gè)輔政大臣商量，什么事情都獨(dú)斷專行。甚至到康熙帝年滿十四歲親自執(zhí)政以后，他還把持朝政，敢在朝堂上誣陷輔政大臣蘇克薩哈，逼迫康熙帝違心地將蘇克薩哈處死。

鰲拜成了康熙帝頭一個(gè)心腹大患，成為康熙帝要清除的一個(gè)目標(biāo)。但宮中衛(wèi)士多是鰲拜挑選的親信，不能信任。康熙帝就借口要練習(xí)摔跤，從貴族子弟中，挑選十多個(gè)棒小伙進(jìn)宮，陪他摔跤。暗地里卻給這些小伙伴作了布置。一天，鰲拜大搖大擺地走進(jìn)內(nèi)宮時(shí)，宮門突然關(guān)上，他自己的衛(wèi)士被隔離在宮門外，十多個(gè)身強(qiáng)力壯的少年，突然跳出來(lái)，將他團(tuán)團(tuán)圍住，拽手的拽手，扳腳的扳腳，將他摔倒在地，捆綁起來(lái)。接著，康熙帝下詔宣布鰲拜的罪行，將他投入監(jiān)獄。

清除鰲拜后，就該解決吳三桂的問題了。當(dāng)時(shí)，驕橫跋扈的藩王，不止吳三桂一個(gè)。廣東有平南王尚可喜，福建有靖南王耿仲明、耿精忠。他們都是早期投降清廷的原明朝官員。因?yàn)楦S清軍入關(guān)打農(nóng)民軍，打明朝軍隊(duì)，打反清義軍賣力，立了“大功”，受到清朝的獎(jiǎng)賞，都有許多特權(quán)，因而非常驕橫起來(lái)，不再肯服從清朝的指揮，妨礙清廷政令的統(tǒng)一，成為潛伏著的新國(guó)家的特大禍害。這三個(gè)藩王，被稱為“三藩”。

康熙帝深感三藩危害的嚴(yán)重性，他將“三藩”與治理黃河、辦理漕運(yùn)作為三件最重要的國(guó)家大事，寫成字條，懸掛在宮殿的柱子上，天天念叨。他一直在苦苦思索，找個(gè)什么辦法，削弱并消滅“三藩”。

“三藩”也深知清廷對(duì)他們的不信任，遲早會(huì)對(duì)付他們，但一時(shí)還吃不準(zhǔn)會(huì)采取什么措施，嚴(yán)厲到什么程度。他們心懷鬼胎，要試探一下朝廷的態(tài)度。平南王尚可喜老了，就上了一道奏章，請(qǐng)求告老還鄉(xiāng)，但要求將王爵傳給兒子，繼續(xù)帶兵鎮(zhèn)守廣東。康熙帝也想借此機(jī)會(huì)試探“三藩”對(duì)撤藩的承受程度，就順?biāo)浦郏鷾?zhǔn)尚可喜告老還鄉(xiāng)，但要撤銷靖南王府，王爵不能繼承。理由是廣東安定，不必再設(shè)藩王鎮(zhèn)守。

這個(gè)答復(fù)，深深震撼三家藩王。吳三桂一面加緊準(zhǔn)備造反，一面邀靖南王耿精忠一道再上奏章，請(qǐng)求康熙帝同時(shí)將“三藩”都撤掉。接到奏章，康熙帝冷笑說(shuō)：“他們竟想威脅我！”就交給議政王大臣會(huì)議討論，大臣們意見不統(tǒng)一，有主張撤的，有主張不撤的。最后康熙帝決定，這些藩王掌握兵權(quán)太久，拖得越久，越不容易解決，索性一次解決，三藩都撤，將全部人員、兵馬遷到關(guān)外去。

吳三桂本意是希望康熙帝會(huì)作出些挽留的姿態(tài)，他們就順?biāo)浦哿粝聛?lái)。誰(shuí)知康熙帝會(huì)這樣決斷，他又驚又恨，決定起兵造反。公元1673年農(nóng)歷十一月，吳三桂殺掉云南巡撫朱國(guó)治，發(fā)布討伐清廷的檄文，自稱“總統(tǒng)天下水陸大元帥，興明討虜大將軍”，并寫信與平南王、靖南王及各地老部下，還有臺(tái)灣的鄭經(jīng)，要他們共同起兵造反。

吳三桂宣布恢復(fù)明朝的發(fā)飾、服裝，革除滿洲的習(xí)俗，要替明朝報(bào)仇雪恨。但是，他引清兵入關(guān)、絞死永歷帝的斑斑劣跡如在眼前，人們?cè)跄芟嘈潘芭d明討虜”的宣傳？他的造反，完全是個(gè)人野心所致。不過，對(duì)清王朝高壓政策長(zhǎng)久感到憤怒的人們，還是找到了一次抒發(fā)胸中悶氣的機(jī)會(huì)，所以，頭幾年內(nèi)，許多地方都起兵響應(yīng)，大半個(gè)中國(guó)都沸騰起來(lái)，清廷的統(tǒng)治岌岌可危。吳三桂的兵馬打到了湖南、江西。

康熙帝臨危不懼，停止執(zhí)行耿精忠、尚可喜兩藩的撤藩命令，將他們從造反行列中暫時(shí)分化出來(lái)，孤立吳三桂;同時(shí)迅速調(diào)兵遣將，阻擋吳三桂的進(jìn)攻。由于吳三桂在軍事上犯了錯(cuò)誤，他的軍事攻勢(shì)持續(xù)了幾年就停止了。雙方在西北、西南、中南、華南相持了八年。公元1678年，吳三桂七十八歲，等不及了，在湖南衡陽(yáng)匆匆忙忙地登上皇帝寶座，國(guó)號(hào)大周。可是到這年秋天，他就病死了。

此后，形勢(shì)大變，清軍的進(jìn)攻越來(lái)越猛烈。到公元1681年，清軍攻下昆明，吳三桂的孫子吳世自殺，“三藩”的叛亂終于徹底平定。