嘉靖三十九年（1560年）初，戚繼光被復(fù)職（此前在岑港之戰(zhàn)，給胡宗憲的嫡系當(dāng)了替罪羊，被革職），就任臺(tái)州、金華、嚴(yán)州參將。此時(shí)，新組建的戚家軍僅成立半年。臺(tái)州原轄軍衛(wèi)2衛(wèi)6所，因軍中逃亡成風(fēng)，此時(shí)的衛(wèi)所軍數(shù)量，最少的只剩下可憐巴巴的20%。要兵無兵，要船無船。衛(wèi)所軍成了這個(gè)敗家子樣，倭寇來了怎么打仗？戚繼光一方面毫不放松戚家軍的訓(xùn)練；另一方面在胡宗憲支持下，大力整頓所轄衛(wèi)所，訓(xùn)練水師。用了一年光景，衛(wèi)所軍中的兵員，恢復(fù)到八成以上，還新造了戰(zhàn)船40余艘，水師力量也得以重新增強(qiáng)（所以說明朝最怕的是沒幾個(gè)人干實(shí)事，認(rèn)真干實(shí)事，怎會(huì)沒有成效）。這一年中，所幸的是沒有大的戰(zhàn)事，倭寇并未大規(guī)模入侵；不然戚繼光真要分身乏術(shù)了。不過侵略成性的倭寇哪里能學(xué)好，果然又來了，而且這次入侵的規(guī)模來了個(gè)更嚇人的。

嘉靖四十年（1561年）四月，倭寇兩萬人連艦數(shù)百，大舉入侵浙江沿海。本來想直搗臺(tái)州，因戚繼光親率水師在海上巡防，倭寇于是改變部署，十九日先派出一部人馬在奉化登陸，當(dāng)夜竄入臺(tái)州治下的寧海劫掠。戚繼光親率軍隊(duì)馳援寧海。倭寇這一手很狡猾，你要是不管寧海，我就繼續(xù)在此殺人放火；可你要是領(lǐng)著臺(tái)州的軍隊(duì)來增援，則臺(tái)州的防守力量就會(huì)減弱，從而大舉進(jìn)攻臺(tái)州。但是戚繼光還是來了，戚家軍于22日到達(dá)寧海，與 早就想見面較量的倭寇打了成軍后的第一仗。

經(jīng)過嚴(yán)格訓(xùn)練的戚家軍戰(zhàn)士開始列出了鴛鴦陣。在中國東南沿海橫行慣了的倭寇眼里，明朝的軍隊(duì)就是不堪一擊的菜鳥，只要自己亡命沖鋒砍殺，用不了多久他們就得調(diào)轉(zhuǎn)屁股玩命的逃跑，我們的武士道和戰(zhàn)刀最牛逼；看你們列的陣，都他媽稀稀疏疏的一點(diǎn)都不嚴(yán)整，這是從哪找來的一幫廢物，不是等著讓我們砍嗎？所以大舉向鴛鴦陣猛撲。結(jié)果剛交上手就發(fā)現(xiàn)，過去的那一套根本就不好使了。

人家對面的這支隊(duì)伍，不光是根本就沒有逃跑的意思；相反是在盾牌掩護(hù)下，殺聲震天，手里用著一堆沒見過的怪玩意向自己推過來。尤其是那個(gè)長長的帶尖頭的還渾身帶刺帶鉤的長玩意簡直是太缺德啦（就是狼筅），刀砍不斷它，還往往遮蔽自己的視線，看不全這玩意后邊的人，還沒等夠著對方的人呢，自己就被劃了個(gè)滿臉花；毀容的算輕的，大多是自己的人被這個(gè)缺德玩意鉤倒掃倒之后，長矛馬上就跟過來玩命往自己身上捅。打了半天。自己身邊的人是一個(gè)一個(gè)往下倒。這仗打得真是窩囊透啦！于是倭寇扔下一堆死尸，掉頭逃竄！此戰(zhàn)戚家軍首戰(zhàn)寧海，就擊敗了猖狂的倭寇，戰(zhàn)果是：倭寇，死傷200；戚家軍，陣亡數(shù)0。此時(shí)海上的倭寇，已經(jīng)在臺(tái)州沿海多路登陸。戚繼光是名將，并未被首戰(zhàn)勝利沖昏頭腦；相反他憑著優(yōu)秀的軍事素養(yǎng)，根據(jù)不斷接收到的情報(bào)，正確判斷出倭寇的圖謀：引誘明軍分散兵力，各個(gè)擊破。更大的仗還在后邊。因此戚繼光果斷的派出把總胡守仁、樓楠火速馳援戰(zhàn)略要地新河。此時(shí)，幾千倭寇已經(jīng)直撲新河。

當(dāng)時(shí)戚繼光的夫人王氏正在新河，城中因精壯大部出征，兵力已經(jīng)空虛。王氏果斷的命令打開武庫，組織婦女身披盔甲上城御敵。26日早，倭寇突然在新河城下遭到胡、樓援軍的攻擊，被打了個(gè)措手不及，這里的倭寇同樣是首次遇見了一支敢玩命的敵手，被兩面夾擊，殺了個(gè)人仰馬翻；無奈占據(jù)鮑家大院，做困獸之斗因石門堅(jiān)固，房屋高大，戚家軍改用火銃射擊，打死倭寇上百人；余下的殘敵乘夜間冒死逃出。還沒打夠呢，你說跑就跑??！戚家軍奮起直追，次日，在溫嶺追上敵人，再次斬首80余級(jí)，倭寇殘部乘大霧逃脫。新河之戰(zhàn)戰(zhàn)果：倭寇，死傷280余人；戚家軍，陣亡3人。

新河之戰(zhàn)時(shí)，戚繼光從其他幾路倭寇的動(dòng)向上判斷，倭寇主力并未全部出現(xiàn)，而他們的的真正目標(biāo)將是臺(tái)州府。遂親率主力回援臺(tái)州。但進(jìn)軍途中出現(xiàn)了一個(gè)問題：軍糧不夠了！馳援寧海，只帶了三天糧食；到了27日是第5天；而距臺(tái)州，尚有70里。戚繼光親自激勵(lì)士氣，動(dòng)員戰(zhàn)斗，全軍空腹跑步行軍；于正午趕到臺(tái)州東南的花街，與倭寇遭遇。此時(shí)戚家軍已是相當(dāng)疲勞，還餓著肚子，但戚繼光激勵(lì)將士“滅賊而后會(huì)食”，全軍遂列陣向倭寇猛攻。這里的倭寇，也是從未見過士氣如此高昂、作戰(zhàn)兇狠的明軍（其實(shí)還不是正規(guī)軍），兵器怪異，陣型奇特，被打了個(gè)七零八落。過去，狡詐兇殘的倭寇慣用自己的一套怪招：接戰(zhàn)時(shí)先上一批披頭散發(fā)、武藝高強(qiáng)的武士，額頭戴面鏡子擾亂明軍視線，跳躍舞蹈，揮舞倭刀，從心理上恐嚇明軍；或是以婦女置前，手舞足蹈表演，分散明軍注意力；背后有頭目用折扇指揮，隨扇子的開合跳躍揮舞兵器，喊聲震天，趁明軍不知所以、疑惑重重之機(jī)，突然向前揮舞扇子，倭寇于是向前猛撲，明軍衛(wèi)所軍本就戰(zhàn)斗力腐朽，作戰(zhàn)精神頹廢；如此經(jīng)常一觸即潰。可是這次，算他們倒霉，對手是戚繼光和一群兇悍敢戰(zhàn)的義烏兵，這一套怪招不好使了。戚家軍隨著號(hào)令勇往直前，你愛怎么得瑟怎么得瑟，我上來就殺，殺！殺！殺！倭寇見狀，我真是敢玩命的碰見不要命的了，跑吧！倭寇分兩路逃跑。戚繼光命令官兵分兩路，繼續(xù)窮追猛打，兩路殘敵終被全殲。

戰(zhàn)斗勝利結(jié)束之時(shí)，午飯剛剛做好。戚家軍在戚繼光率領(lǐng)下，餓著肚子長途奔襲幾十里，并立即投入戰(zhàn)斗，還打了個(gè)多少年罕見的殲滅戰(zhàn)，這一仗打的真是揚(yáng)眉吐氣！戚家軍威武！花街之戰(zhàn)戰(zhàn)果：倭寇：被斬首380余級(jí)；另有被趕到海中溺死者無算，雖未留下人頭，但也是見了閻王，傷亡在千人左右，這一路倭寇幾乎是全軍覆沒；兩名倭寇頭目被擒。戚家軍：陣亡3人。解救出被擄百姓5000余；繳獲各類兵器650件。還有其他路的倭寇呢，仗還沒打完呢。之后，又爆發(fā)了上峰嶺之戰(zhàn)。另一路登陸的2000余倭寇，見臺(tái)州府不可輕取，便退兵以另尋進(jìn)攻目標(biāo)。戚繼光據(jù)情報(bào)判斷，倭寇將進(jìn)犯仙居、處州；如此上峰嶺是必經(jīng)之路；遂大膽決定在上峰嶺設(shè)伏。此時(shí)因不少兵力用于要地駐防，戚繼光僅有兵力1300人，如此是以寡擊眾。戚繼光就是戚繼光，我現(xiàn)在練出的兵軍隊(duì)，與龍山之戰(zhàn)那樣的廢材油頭軍隊(duì)根本不同，我就是敢打！戰(zhàn)前，這位名將和監(jiān)軍趙大河做戰(zhàn)前動(dòng)員，頒布了三條嚴(yán)格的紀(jì)律：

1，不以個(gè)人繳納首級(jí)計(jì)功，而以戰(zhàn)勝計(jì)功。明軍計(jì)功的唯一標(biāo)準(zhǔn)，是繳納首級(jí)；因此以往的明軍，戰(zhàn)斗中經(jīng)常是打死一個(gè)敵人就爭搶人頭，甚至鬧內(nèi)訌，仗還沒打完自己陣型、隊(duì)形先亂套，而敵人卻乘機(jī)反撲，往往導(dǎo)致明軍先勝后敗。戚繼光嚴(yán)令戰(zhàn)士上了戰(zhàn)場必須一往無前，誰也不許去割首級(jí)，由后方的收容隊(duì)負(fù)責(zé)收取首級(jí)?？倲?shù)有了以后，根據(jù)戰(zhàn)斗分工任務(wù)、實(shí)戰(zhàn)表現(xiàn)分配到基層各隊(duì)；隊(duì)再分配給個(gè)人。例如擔(dān)負(fù)沖鋒、阻擊任務(wù)的隊(duì)伍，很難獲取首級(jí)，但是人家賣命打仗最苦犧牲最多了，按照以個(gè)人繳納首級(jí)的辦法明顯不科學(xué)不公平，因此戰(zhàn)后統(tǒng)一往下分功給予獎(jiǎng)勵(lì)。（幾十年后在朝鮮，楊鎬和麻貴以4萬明軍進(jìn)攻清正義雄2萬日軍，結(jié)果卻反勝為敗，首要原因就是楊鎬命令明軍停止繼續(xù)進(jìn)攻，而去爭奪首級(jí)）

2，禁止在戰(zhàn)場上搶奪戰(zhàn)利品。以防倭寇在戰(zhàn)場拋灑金銀財(cái)物，待明軍爭搶時(shí)突然反擊；所有戰(zhàn)利品，由收容隊(duì)專門收集，戰(zhàn)后對軍中有功者獎(jiǎng)勵(lì)。

3，不準(zhǔn)殺脅從。倭寇隊(duì)伍中，有不少是被脅迫過去的明朝百姓，不問青紅皂白殺這類人，是逼著他們反抗，反倒壯大倭寇力量。

五月初四，戚家軍趕至上峰嶺設(shè)伏，人手一支松樹枝，遠(yuǎn)望像松樹林。初五，倭寇出現(xiàn)了，見松林而不見有人，誤以為安全，遂列縱隊(duì)進(jìn)發(fā)。戚繼光了解倭寇行軍，歷來是精兵放在首尾兩頭，中間為弱兵，所以耐心等倭寇隊(duì)伍經(jīng)過一半后，下令攻擊。戚家軍官兵拋掉樹枝，向伏擊圈內(nèi)的倭寇發(fā)動(dòng)猛攻。倭寇措手不及，隊(duì)伍被分割，并逐個(gè)被吃掉，有的開始四散逃命。戚繼光令部下在山頭立起白旗，并大喊，有脅從者至白旗下，不問罪！當(dāng)即有數(shù)百人跑到白旗下，扔掉武器投降。向回逃跑的倭寇，退路也被戚繼軍一部封死，走投無路之下，只得逃上上界嶺。戚繼軍窮追猛打，倭寇有不少人被殺下懸崖。殘存倭寇逃入白洋鎮(zhèn)，占據(jù)朱家大院頑抗。戚繼軍追趕不舍，包圍大院，采用火攻、火器攻擊，徹底殲滅了殘敵。這一仗，戚家軍以少勝多，又打了個(gè)殲滅戰(zhàn)。此戰(zhàn)戰(zhàn)果：倭寇，5名頭目被俘；被斬首344級(jí)；另有燒死的無法砍頭。戚家軍，陣亡3人；繳獲兵器1490件，解救出被擄百姓千余人。

自此來犯的倭寇，僅余從寧海之戰(zhàn)逃走的一部。他們帶著大量被擄掠的明朝百姓跑到溫嶺東南登陸，結(jié)寨屯兵筑壘。被擄去的中國百姓，男人一律剃光頭發(fā)，打赤腳，當(dāng)苦力，大半被折磨致死；女人更是慘遭凌虐。五月二十日，戚繼光指揮水陸軍并進(jìn)，在凌晨突然發(fā)動(dòng)進(jìn)攻，殺聲震天。倭寇亂作一團(tuán)，倉促抵抗了一陣，就紛紛向海上逃跑，以圖上船；不想戚繼光已命水師封鎖海面，焚燒倭寇船只。倭寇有不少人被逼的干脆跳海游泳，結(jié)果遇到了大風(fēng)大浪，跳海的全部葬身魚腹。在海灘上的頑敵被逐漸擠壓，終至被殲。有300余名倭寇乘船10艘正在外面劫掠，聞聽老巢被端掉，想乘船逃亡。結(jié)果戚繼光訓(xùn)練出的水師又將其截殺，對中國百姓多年血債累累的敵酋健如郎、五郎如郎被俘；其余全部被殲。

此戰(zhàn)戰(zhàn)果：倭寇被殺、溺死海上者無算；其建立的陸上小根據(jù)地被端掉。戚家軍解救被擄百姓達(dá)12000余人；繳獲兵器3240余件、倭船11艘。以上諸戰(zhàn)斗，合為一個(gè)戰(zhàn)役，史稱“臺(tái)州大捷”。戚家軍自組建以來，剛上戰(zhàn)場，而且面對的是倭寇大規(guī)模的多路入侵，就在浙江打了一系列殲滅戰(zhàn)，倭寇在中國東南揮舞屠刀，曾經(jīng)猖獗無比；這次戚家軍橫空出世，生生給不可一世的倭寇來了個(gè)“斷刀”；令倭寇“只檣不返，而賊部中梟雄悉絕”；倭寇被戚繼光打怕了，稱戚繼光為“虎”，見戚家軍膽寒，患上了“恐戚癥”。而戚家軍的傷亡率卻遠(yuǎn)低于敵人。連胡宗憲都高興的說，這仗打得真是“痛快”！

在幾年前戚繼光大力建議練新兵、對倭寇打殲滅戰(zhàn)之時(shí)，還有人無恥的笑話他，甚至更有甚者說“從未聞倭可殺者。”現(xiàn)在戚繼光用事實(shí)，給了那幫尸位素餐者一個(gè)響亮的大嘴巴。臺(tái)州大捷后，總督胡宗憲向朝廷奏疏：“嘉靖四十年四五月，倭賊分犯臺(tái)州水陸諸處，臺(tái)金嚴(yán)參將戚某，共擒斬倭首一千四百二十六夷，焚溺死者四千有余；身經(jīng)百戰(zhàn)，勇冠三軍。持秉廉公而士心咸服，令行禁止而軍容整齊。執(zhí)銳披堅(jiān)，見賊則輕身先進(jìn)；絕甘痛苦，遇士則推腹不疑，隨旌旗之所指，即捷報(bào)之連聞。臺(tái)民共倚為長城，東浙實(shí)資其保障。功當(dāng)首論，破格優(yōu)錄，以風(fēng)諸將也?！逼堇^光遂被破格提拔為都指揮，時(shí)年僅34歲。