故事得從遠(yuǎn)古時(shí)代講起。那時(shí)候，地球上出現(xiàn)了最早的生物，猿猴。隨著地理變遷，一部分猿猴留在了陸地，一部分猿猴住進(jìn)了水里。慢慢地住進(jìn)水里的猿猴雙腳蛻化變成了魚尾。人與魚類一直和平共處，直到六百年前。這一時(shí)期，人類文明得以快速發(fā)展，尤其是航海業(yè)逐漸興起。

在遙遠(yuǎn)的東方有一個文明古國，國家出現(xiàn)了一個人。生于1371年的三寶。1381年，三寶因?yàn)閼?zhàn)爭被閹變成太監(jiān)，被送至朱棣的燕王府。隨后，屢立戰(zhàn)功深受燕王賞識。1404年燕王登基，史稱明成祖。而三寶被賜名鄭和，受皇帝之命造船航海，下西洋以揚(yáng)國威。1405年三寶率領(lǐng)兩萬余名官兵出航，先后到達(dá)各國。在途徑印度洋西海岸古里海域時(shí)，撞見了一名海盜頭領(lǐng)，陳祖義。陳祖義盤踞馬六甲10多年為海盜，集團(tuán)成員超過萬人，戰(zhàn)船百艘，是明成祖的心頭大患。

是時(shí)只見陳祖義眾人正在瘋狂捕殺海中魚類，三寶見狀立即率領(lǐng)艦船靠前。等到靠近時(shí)才發(fā)現(xiàn)，海盜們捕殺的不是一般魚類，而是上身為人下身為魚的生物。三寶沒有想太多，立即向敵船開炮，雙方戰(zhàn)斗數(shù)個時(shí)辰，終于擒獲陳祖義。隨后搜查盜賊船只時(shí)，發(fā)現(xiàn)船艙全是半人半魚的生物，或死或傷。追問下才得知陳祖義名為海盜，實(shí)為追蹤捕殺海洋的“美人魚”，以提煉藥物延長壽命。三寶生性善良耿直，毅然放走了所有的人魚，人魚也央求三寶不要對外界透露他們的存在。

1407年三寶回國，陳祖義被皇帝下詔砍頭，不料臨刑前對皇帝說“海上有魚，上身為人，得之可長生不老，我愿意前往替...”話聲未完，三寶手起刀落，“皇上，切勿聽信小人之言?！被实垡谎晕窗l(fā)，走了。十幾天后，三寶又一次受命二下西洋。臨行前，皇帝對三寶委婉表達(dá)了尋找人魚之事，三寶愁云滿面的點(diǎn)了頭。1409年，在外佯裝圍捕人魚兩年后，三寶回國，稱未找到人魚。同年十月，三寶第三次受命下西洋，隨行的還有皇帝主要謀士姚廣孝。姚廣孝是一代高僧，法名道衍，皇帝的心腹。

皇帝之意三寶心知肚明。船隊(duì)出發(fā)，行至印度海域時(shí)，姚廣孝終于發(fā)現(xiàn)人魚蹤跡。面對堅(jiān)船利炮，縱使人魚本領(lǐng)通天，終究輸給了冷兵器。人魚悉數(shù)落入姚廣孝之手，就在啟程回國之時(shí)，三寶偷偷告訴姚廣孝，人魚知道佛牙的下落。佛牙指的就是釋迦牟尼佛未燒盡的遺骨殘片的牙齒，也就是舍利。對一個僧人來說，世間恐怕難有比這更為貴重的東西了。為得佛牙，姚廣孝決定依靠人魚之力。人魚一族遂聽從三寶的建議，帶領(lǐng)船隊(duì)到達(dá)印度洋海域的獅子國(今天的斯里蘭卡)，在那里取得佛牙。姚廣孝想捉拿人魚回國交差，卻被三寶及時(shí)勸阻。

一方面，長生不老只是道聽途說，沒有可信根據(jù)。另一方面，朱棣篡位建文帝上臺，為了證明自己的正統(tǒng)地位也需要效仿古代帝王迎佛牙，以平息民間的不滿和反抗情緒。此次佛牙到手，既可以圓皇帝心愿，也能避免殘殺無辜，也算功德無量之事。姚廣孝本為出家之人，自然懂得其中利害，于是放走人魚，于1411年回國?；实垡娪胤鹧溃匀淮笙?，于是不再追究圍捕人魚失利之事。而三寶一心想再見人魚，所以自動請纓，以弘揚(yáng)國威捉拿人魚的名義又下西洋三次。

第四次和第五次下西洋，三寶教會了人魚制造兵器、建造戰(zhàn)船等技藝。在第六次下西洋途中，船隊(duì)遭遇風(fēng)暴，險(xiǎn)些喪命，所幸得到人魚相救，船隊(duì)才得以返回。1422年，高祖皇帝去世，仁宗即位。見三寶下西洋并無實(shí)獲，于是下令停止下西洋的行動。三寶日日思念人魚，終于向皇帝求情，愿意再替皇帝去海域?qū)ふ覀髡f中的人魚，以獲長生之術(shù)?；实蹜?yīng)允。1431年，三寶七下西洋。臨行前他告訴皇帝，自己若是以身殉國，還請善待鄭家后代。隨后，在行至印度西海岸古里時(shí)，船隊(duì)遭遇風(fēng)暴，風(fēng)暴過后三寶于人間消失。

消息傳回國后，皇帝厚待其家人。并下令翻閱查看七下西洋的航海記錄，以期找到人魚線索。不料三寶航海資料憑空消失，加之朝中再無卓越航海家，皇帝遂作罷。而在遙遠(yuǎn)的印度洋某個角落，三寶繼續(xù)將畢生所知教給人魚一族，以保族類平安。